马达加斯加岛位于非洲大陆的东南海面上，为仅次于格陵兰、新几内亚（也称伊里安）和加里曼丹的世界第四大岛，隔莫桑比克海峡与非洲大陆相望，最近距离为３８６公里。面积为６２．７万平方公里。马达加斯加岛是向西倾斜而多山的陆块。岛的形状呈狭长形，南北窄、中部宽，全境最宽处达５７６公里。海岸线总长３９９１公里。
马达加斯加全岛由火山岩构成。中央部分平均海拨８００-１５００米，通常被称为中央高原。察拉塔纳纳山主峰马鲁穆库特鲁山位于高原的北部，海拨２８７６米，为全国最高点。位于中央高原的阿劳特拉湖，是马达加斯加的最大湖泊。东部为带状低地，多沙丘和泻湖。西部为缓倾斜平原，从５００米高原逐渐下降到沿海平原。有贝齐布卡、齐里比希纳、曼古基和曼古鲁４条较河流。
2000多年前，人类首次从亚洲和非洲移居于此，从此对这里造成了深刻的影响。马达加斯加的独特的历史似乎可以解释它不同寻常的丰富物种——大约有20多万种动植物，包括fossa、小型食肉动物和大约35种狐猴在内，这些都是地球上的其它地方所没有的。由于马达加斯加岛的森林限制， fossa是岛屿上最大的野兽。这里还有青葱茂盛的雨林与烈日灼人的平原并存，就连这里的树冠，都像是伸向天空的树根。这里充满了奇异的、多刺的植物和众多冷峻的石笋。这里是一个展示生命无比神奇的、多样性的博物馆。
马达加斯加全岛几乎均位于热带区域，在气候上受风系与海拨高度的影响。东南沿海属热带雨林气候，终年湿热，季节变化不明显，年平均气温２４℃，年降水量２０００-３０００毫米。生长着茂密的热带植物和森林。中部为热带高原气候，温和凉爽，土地肥沃。西部为热带草原气候，西南部是全岛最炎热的半荒漠地区，年平均气温２６．６℃。
